经过修复和重新剪辑的终极版《东邪西毒》。片子取材于金庸的武侠神作《射雕英雄传》，但故事的主线变成了原著中不受人待见的欧阳锋（张国荣 饰）。欧阳锋因为昔日恋人（张曼玉 饰）赌气嫁给兄长而离开家乡白驼山，来到大漠中开了一家专门介绍杀手的酒舍。在沙漠的自我放逐中他重逢了好友黄药师（梁家辉 饰），遇见了精分的慕容嫣（林青霞 饰），深情的想念妻子桃花（刘嘉玲 饰）却不想相见的夕阳武士（梁朝伟 饰），倔强的复仇孤女（杨采妮 饰），初来闯荡江湖的不穿鞋的洪七（张学友 饰）。在经历了他人的生死、感情纠葛之后，欧阳锋得知了恋人的死讯，一切得到释然后他烧毁了酒舍，离开了沙漠……
　　修复版和94年版在画面、时长、配乐、标题、对白、镜头上都略有不同。

　　从小右臂就具神力的大陆青年刘晶（周星驰 饰）来港不久便接连遭遇倒霉事，先是钱包被偷，而后行李也遭人抢劫，不过也因此结识放荡不羁的潇洒（钟镇涛 饰）。刘晶四处寻找工作，却迟迟未定，甚至还卷入黑帮斗争之中。走投无路之际，刘晶和潇洒决定参加散打比赛，更阴差阳错拜入具有黑社会性质的赵东拳馆。在黑社会师傅（成奎安 饰）的带领下，二人随同前去夜袭霍家拳馆的霍环师傅，籍此机缘，刘晶得以拜入霍师傅门下。二人都对师傅的女儿嘉敏（张敏 饰）存有好感，也由此闹出不少笑话。然而门下大师兄（尹扬明 饰）嫉恨刘晶，设计陷害，致使刘晶被逐出师门。他的未来将何去何从……

瘦虎（麦嘉 饰）和肥龙（洪金宝 饰）是警局里的最佳拍档，屡立奇功。这次，他们收到消息，前往追捕大毒贩太子德。不料，两人和太子德的一番龙争虎斗，竟然意外搅祸了香港警务处副处长的婚礼，虽然最终拘捕了太子德，两人却因激怒了上司而不得不暂时休假。两人趁闲来无事，前往新加坡旅 游，意外结识了两名当地女子并成为好友。岂料，这时太子德保释外出，为了报仇雪恨，特意雇了杀手前往新加坡找瘦虎、肥龙寻仇。两人虽然大难不死，但却连累了两位好友身受重伤。由于正在停职期间，两人决定以牙还牙！

　　京剧武生关玉楼（狄龙）的猝死引来其弟关小楼（姜大卫）对两人过往点滴的深情回忆，伤情之余，小楼在蛛丝马迹中发现其兄之死可能另有隐情，展开调查，发现真相是与嫂子花正芬（区燕青）有染的国术馆长封开山（谷峰）联合金志全（杨志卿）等人设计将玉楼害死，决意为兄报仇。
　　由于杀害玉楼的凶手众多，小楼误中奸计，险象环生，幸得花正芬的胞妹花正芳（汪萍）用美人计诱敌，才终将封开山杀死。金志全怕小楼向自己下手，假称杀害玉楼的幕后主脑人实为大帅胡智虎。小楼深知金志全老奸巨滑，口上答应与他合谋除去胡智虎，一场关乎两人生死的赌局展开。

　　大陆某部级高官涉嫌指派情妇来港洗钱，且金额巨大。为此，ICAC（廉政公署）陆志廉（古天乐 饰）和JFIU（联合财富情报组）刘保强（张智霖 饰）联合展开调查。可就在此时，陆被指控巨额财产来路不明，遭到廉政公署L组（内部纪律调查组）程德明（郑嘉颖 饰）的调查，并最终得到停职的处分。为证明自己清白，陆志廉千方百计找到举报自己的女孩Eva（邓丽欣 饰），发现这一切都与正在调查的洗黑钱案件息息相关。未过多久，中国反贪局侦查处处长洪亮（丁海峰 饰）也来到香港，其矛头正是洗钱案的幕后首脑张部长（冯雷 饰）。
　　两岸联动，多部合作，与黑恶势力展开殊死较量……

　　严太师遇刺毙命，护卫范义追击刺客至穷巷，见他踏镖逾墙逸去，而镖乃寇英之器，范遂遍城贴满通缉寇的画像。寇取得遇害县官宋化龙身上的公文，得以入城，却仍为范捉拿，幸得酒店店主的女儿雪娘，自认寇是其表哥，寇才幸免被捕；寇向雪道出自己的身份及真相。其后，范遭假扮成寇的寨主贺西雷袭击，而救回他的竟是。

　　阿东是一名大陆人，他打算去香港探望奶奶，但是他的双程证和单程证都没有办下来，于是就偷渡来了香港。阿东的运气实在不好，刚踏上香港的土地就碰到警察抓偷渡客，阿东不幸被抓，但是精灵的他趁警察看管不严又逃脱了。阿东来找多年前来到香港的邻居阿正，在阿正家楼下又遇到了警察，阿东抱起一个小女孩做了掩护，小女孩的母亲看到阿东手上的铐子没敢做声。警察走后阿东对母女俩表示歉意。阿东来到阿正家，发现满屋的警察。原来，来香港多年的阿正已经做了警察，和同为警察的阿花就要结婚了,所以今天请同事来热闹一下。阿正看到阿东十分激动，并介绍他认识阿花，阿正看到他手上的铐子，问起情况才知道他是偷渡来的，赶忙把他藏在里屋。晚上同事们都散去，兄弟两个才聚在一起。阿东把来香港看奶奶的想法和阿正说了，阿正知道偷渡是犯法的，但是和阿东多年的情分只好答应他一起去看奶奶并暗中保护他。阿花看在心里不仅有些担心，怕阿东一旦被抓会影响阿正的前途。 　　阿东和阿正买了礼物一起去看奶奶，谁知道奶奶三个月以前已经去世了，因为身边没有子女，遗体被拿到香港大学准备供学生尸体解剖用。阿东十分着急，阿正安慰他并答应他自己会把奶奶的尸体找回来让她入土为安。阿正怕阿东外出不安全，让他待在家里。阿东在家里正无聊，突然有人敲门，他打开一看原来是那天碰到的小女孩，小女孩哭着让阿东救救妈妈，阿东跟着小女孩来到她家。一名中年男子正在打小女孩的母亲，阿东上前制止却被男子不由分说打了一顿，并警告阿东离他老婆远点。原来男子是小女孩的父亲，叫吴国雄。表面上是一名风光的商人，当前热门的慈善节目“推冰传爱心”就是他主办的，可实际上他还欠着高利贷。今天就是回来找老婆要钱的。没有拿到钱，他悻悻离开。 　　母女俩见阿东无辜受累，很是过意不去。阿东十分喜欢小女孩，知道她叫小苹果没事就哄她玩。一来二去，阿东与小苹果的妈妈有了感情，阿东耻于自己的身份不敢表达，直到一次情不自禁说了出来，没想到小苹果的妈妈接受了他，原来她与吴国雄没有婚姻关系。阿花见阿东一直待在香港没有离开的意思，怕阿正受到他的连累，于是逼阿东离开。阿正得知后与阿花反目。阿东离开后一直想念小苹果，这天忍不住来看她，发现小苹果被吴国雄绑架了，要小苹果的妈妈拿三十万来赎人。阿东赶忙找阿正帮忙。阿东、阿正、阿花三人来到“推冰传爱心”的现场，吴国雄在这里已经设好了机关，欲置三人于死地，幸亏阿东舍命相拼才救出小苹果。阿正和阿花也在这场搏斗中相互原谅。虽然阿东是一个救人英雄但是无法改变他是偷渡客的身份，法律无情，他还是被抓了起来。

　　缉毒总督察李振邦（张家辉 饰）和卧底警员江铭（陈伟霆 饰）秘密执行追捕毒贩计划，无奈遭遇险境，江铭被迫游走黑白边缘，逐渐失控。为坚守底线，昔日队友互生杀意。猜忌、愤怒、疯狂、失望……全员丧失理智，濒临崩溃边缘！

　　陈荣（三毛）是镇上一酷爱功夫的青年，荣四处寻访武师教头比武，一心要找到比自己厉害的人拜习功夫。一日，阿荣在镇上巧遇梁仲友（梁家仁），梁出手救人显露了功夫。荣死缠滥打定要拜其为师，被梁拒绝，而阿荣的一番纠缠也渐渐引出梁的一段故事。梁自幼丧亲，乞讨街头，被好心的李教头收为义子并传授功夫。李的独子（张翼）虽身为武馆大师兄，但为人狭隘阴险，幼时被梁不慎误伤右眼，从此嫉恨在心。梁的大喜之日，师兄强暴新娘未遂，兄弟二人多年的积怨终成仇恨。师兄欲暗中除梁夺美而后快，梁恐二虎相争，只得携妻出走闭过风头。李师傅风烛残年不久于人世，梁与妻并阿荣前来送终。老人一断气，师兄便对梁大开杀戒，眼见梁、荣二人寡不敌众，新婚妻子只得牺牲自己让两人脱身。碍于师傅生前的恩情和邻终的嘱咐，梁只能将仇恨压于心底。但大师兄不肯善罢甘休，欲将梁赶尽杀绝，他以阿荣的母亲做要挟，让荣处掉梁。荣与梁将计就计，上演了一出瞒天过海。来到李府却不想真入虎穴，荣和母亲惨遭杀害，梁终于忍无可忍，与师兄和为虎作伥的众打手展开一场疯狂血战。

　　警署的危险生活，警员倪方作卧底，潜入黑社会的人员当中，然而这时女友被劫作人质，危难之中，女友是死是活？

　　年轻的小宝（李艺民）为了替父报仇，立志学武。他的求学之心被“正心馆”的棋拳大师（王将）及老厨师（袁小田）所认可。师徒共同设计了一套将象棋拳法和五行拳法完美结合的招式，向滥杀无辜的五行拳杀手（龙冠武）发起挑战。

　　凌靖（黄晓明 饰）连续四年成为香港警察狙击手队伍的第一神枪手，上司与队友对他赞赏有嘉，可自视甚高的他却不大喜欢跟人家打交道，他唯一的幸福就是太太的陪伴。一次剿匪行动中，凌靖失手打死人质——城中首富独子。富商向警察部不断施压，最后凌靖被判误杀入狱四年。自从凌靖离开，原来警队第二的克明（任贤齐 饰）成为了最强的一个，当年正是他做假证害凌靖入狱。凌靖发誓要向出卖他的警队和克明报仇。
　　O仔（陈冠希 饰）是警校的高材生，枪法如神、用枪技术一流，很快被克明招揽加入香港警察狙击队队伍。在听说在凌靖的故事后对他感到好奇，在偶然的机会下遇到凌靖并得到指导，成为朋友。
　　凌靖频繁挑衅警队，引得整个狙击手队伍出动围捕他。凌靖拼死力战，独战警队。怎料，克明以自己作饵，加上O仔的助攻，让他不慎暴露了位置。最后，到底哪方会胜利？而凌靖又可以为自己找到应有的公平吗？

　　付藏的父亲在付藏很小的时候，因为和他人的纠纷被人杀害，他变得沉默寡言，一日，他遇到一个降头师，那人交给了他降头术。
　　陈东被蛇咬死，引起了警察（郑浩南）的追踪，他们怀疑是养蛇大户卡罗王干的。付藏爱慕卡雨露，一天，他带着一束鲜花到卡罗王家去拜会她，结果被卡雨露的追求者李彬痛打一顿，李彬、方琦（张茜）和卡雨露（李思蓓）三人随后到夜店去唱歌跳舞，活动结束后，卡雨露和李彬支走方琦，两人到公园里打算偷欢，因为尿急，李彬到灌木丛去撒尿，结果被付藏使用降头术驱使毒蛇咬死了。
　　多日之后，是付藏父亲的祭日，他打电话给姑母，请她和姑父到他家来参加祭奠仪式，因为姑父中风，她委派了自己的女儿如梦（钟淑慧）代表参加。警方查到了付藏曾被李彬殴打，来到李彬家里调查，被李彬巧妙地应付过去。
　　一日，付藏带着表妹出去散心，碰到了卡雨露、方琦和她的追求者，付藏再次被“癞皮狗”及其帮手殴打了一顿，回家后，付藏使用降头术来对付他们，使得他们三人都被毒蛇咬死。后来在付藏作法时，不小心被表妹如梦看到，他把如梦用绳子帮了起来。因为多日不见如梦回香港，她的丈夫便到付藏家来找她，也被付藏抓了起来，和其妻子如梦绑在一起。有一天，付藏又在神龛前面作法，把在家的卡雨露勾到了自己家中。趁此良机，如梦催着丈夫解开绳子，两人匆匆跑到警察局报案，警察随后来到付藏家中，将付藏抓获。

方世玉（小侯）因与大清武馆高手（刘家良）结怨，其母苗翠花（李丽丽）为避冲突，暗带方上少林寺，求三德和尚（刘家辉）收其为俗家弟子；方入寺后自恃功夫了得频频闯祸，终被三德逐出。奸人提督（白彪）乘势诱方邀同房九杰离寺，暗图一网打尽；十杰失踪，三德心知有异，遂约苗同往督府对付旗兵……

　　警员阿海（刘青云 饰）事业上精明能干，但与妻子（李若彤 饰）的关系十分恶劣，妻子更怀上了别人的孩子，婚姻濒临破裂。阿海在与歹徒搏斗的时候脑部中枪，自此失去了味觉。妻子全力照顾，两人的关系也开始转好。没想到该歹徒逃脱成功，并绑架了阿海的妻子要挟阿海出现，在枪林弹雨中与歹徒时，阿海才发现自己一生中最爱的人还是自己的妻子。歹徒挟持着妻子，并告诉阿海房间内已充满了煤气，只要阿海开枪便会爆炸，事实上阿海已经失去了味觉……

　　贺力王（樊少皇 饰）自幼蛮力过人，后经家族之世交善鬼（丹波哲郎 饰）指点，习得精纯硬气功。力王女友莹莹意外撞破毒贩交易，毒贩将莹莹捉回使其坠楼身亡，力王击毙毒贩为女友报仇，因此被关入国分监狱。时值2001年，监狱被私人承包成为盈利工具，犯人遭受残暴对待苦不堪言。力王不能容忍国分监狱北仓杀手山猫欺凌弱小，出手将其重伤，触怒北仓天王鸣海，副监狱长单眼蛇挑斗二人对决，力王出手轰杀鸣海，自此卷入与国分监狱四仓中其他三大天王黄泉、泰山、白神的连番战斗。力王烧毁监狱中的罂粟地，使度假归来的监狱所长（何家驹 饰）大为光火，而同样习练硬气功的所长，将是力王最强大的敌人……
　　本片根据同名日本漫画改编。

　　中国南拳冠军李凤之兄虎于代表拳馆出赛时，遭对手龙老板手下拳师周施计下惨死。风为办理兄后事而暂住拳馆中。虎徒弟南及流氓亚贤同爱慕风，闹出不少笑话。当风知道南打假拳以博取微利偿还拳馆债务，决定以30万元作赌注，跟杀兄之周决斗。比赛中，凤发现对手和龙老板串谋再出古惹以谋彩金，奋战下击毙周，令龙老板人财两失，誓要报仇，掳走南以威胁凤再决战。凤和贤遂于擂台上下，和龙老板展开一场火爆之追逐战……

　　在一次抢劫行动中，绑匪拒捕、杀人、挟持人质，警方要求飞虎队支持。由阿Mike带领的小队，成功地围捕绑匪，当阿Mike说服劫匪放下武器的时候，阿满一枪打死了劫匪头目占士，因为这些悍匪应该要死。这件事令Mike和阿满的友情受到考验，因为Mike考虑是否要指证他。而此时，阿满的妹妹阿诗突然被杀，一场报复行动开始了……

　　高级督察清见和丽容负责协助美国CIA碧姬，当奴和安娜押解重犯东阳返美国。山区大王手下差夫为夺取东阳手上的国防机电脑磁片，派出杀手伏劫，东阳在混乱中被杀，磁片更被杀手团抢去，众人不惜越洋追捕，并获当地军方协助，突破山区哨站及埋伏重兵，行动中揭穿安娜是杀手团派来的奸细，终被当奴解决，最后只剩差夫一人，但在众人和军警支援下，终把差夫和整个山区组织歼灭。

　　1898年山东大旱，无数难民涌入上海求生，人流中马永贞（金城武 饰）、马大祥（元华 饰）兄弟俩亦来到这片英国人掌控下的东方乐园，二马无技傍身，只好从码头苦力做起。马永贞机缘巧合结识上海码头之王谭四（元彪 饰），并凭借出色身手获得其欣赏。其时谭四与巡捕房支持的杨双连番血战，马永贞遭遇混战，为谭四的一壶春舞厅出手击退强敌，对卖场其中的歌女金铃子（宣萱 饰）一见钟情。谭四感佩马永贞义气，将一壶春和老板娘艳阳天一同赠送之。马永贞遂以一壶春为起点，率众攻占杨双地盘，激起上海滩无数杀伐。马永贞遭遇杨双暗算，命悬一线之际却再遇金铃子……

　　1956年十月，香港政治部督察李洛夫（吕良伟 饰）在处理一起暴动事件时，捉到了几名趁火打劫的黑社会分子，上峰对他的表现非常满意，派其前往伦敦受训。另一方面，大陆黑社会分子李裁法（李子雄 饰）因杀人被帮会驱逐到香港开辟毒品生意。李洛夫学成归来，担任反黑组督察，然而组内同事人浮于事，只有老资格的炳叔（黄光亮 饰）和嗜酒的郑华（任达华 饰）愿意尽力辅助。李洛夫试图铲除赌档，却走漏消息受人捉弄，继而采用声东击西战术一夜铲除三百赌档，威震香港。靠暴力打出势力范围的李裁法欲贿赂李洛夫却不得，两位黑白枭雄的对决不可避免……
　　本片改编自香港警界传奇人物李洛夫的故事。

　　无忌（关礼杰饰）与父（叶荣祖饰）以做黄色招牌为生，偶然之下，被一名伴唱少女Katie（容儿饰）误以为是警察。Katie因朋友 而被毒枭Bob（周比利饰）迫其以身偿债，Katie遂以无忌及其警察挚友钊（霍瑞华饰）为挡箭牌，与Bob屡起冲突，Bob一怒之下杀无忌 父及拐走Katie将其轮奸。无忌不想连累朋友，将钊打晕并夺其配枪，准备与 Bob决一死战……

　　阿华（刘德华 饰）一直想当一名好警察，正当他得到了好机会正想大展拳脚的时候，他被调至的小组意志十分消沉，完全没有工作的干劲。他们的队伍常常受到另一队由张扬（张耀扬 饰）的出色人马藐视。阿华十分不满扬的作风，更在一次行动中与之发生冲突。
　　阿华的母亲（林建明 饰）召回了家中，因为阿华的女友阿兰（张曼玉 饰）受父亲（秦沛 饰）所逼要嫁给一个与她完全没有感情的有钱人，阿兰的父亲更是阿华的师傅，情与义之间不知如何抉择。令阿华更加烦恼的是，自己的母亲竟然与自己的同事秋（黄秋生 饰）发生了感情。
　　回到警察局后，一群匪徒企图闯进入拯救自己的同党，但阿华成功擒拿匪徒的功劳竟然被张扬设计夺走。忍无可忍的阿华决定与张扬在跆拳道赛中一决胜负。

　　清朝初年，朝廷有令民间不得习武，少林寺方丈深知这是清廷视武学发源地的少林寺为肉中刺欲除掉的结果，预感少林寺迟早会遭大劫，决定广收俗家弟子予以栽培，将少林绝学遍布民间，以期造成“野草烧不尽”之势。消息一号，渴望习武的血性男儿纷纷响应，其中以方世玉（傅声）、胡惠干（戚冠军）、洪熙官（韦弘）等人求武之心最诚，终入少林寺大门，与他们一同入寺的，还有胡德帝（姜大卫）、蔡德忠（狄龙）等反清义士。
　　众人虽为大义而来，各人心里却有不同的小九九，并逐渐归入不同派别。而最终成为正义一方的方世玉与胡德帝等人以少林绝学了却了自己的仇恨后，发觉清兵已对少林寺展开偷袭行动，决意为少林寺赴汤蹈火。